松本短期大学は、平成29年度(一財)短期大学基準協会による第三者評価の結果、適格と認定されました。
平成14年の学校教育法の改正を経て、16年度から全国すべての短期大学において、7年に一度、専門の審査機関により、教育研究・組織運営・施設設備・財務等の総合的状況について、文部科学大臣の認証を受けたもの(認定評価機関)による評価(認証評価)を定期的に受けることが義務付けられております。
過去に本学では、平成16年度・平成22年度に評価を受けました。29年度は、48校が短期大学評価基準を満たしているとし、松本短期大学は、平成30年3月9日付で「適格」の認証を受けております。